San Juan Capistrano oferece um ambiente amigável para pedestres, especialmente em sua área central, onde muitas atrações estão localizadas a uma curta distância a pé. O distrito histórico, que inclui a Missão e a rua Los Rios, é compacto e fácil de percorrer a pé, com calçadas e faixas de pedestres que garantem acesso seguro. O clima ameno do sul da Califórnia também favorece as caminhadas como opção de deslocamento. No entanto, áreas fora do centro podem exigir outras formas de transporte devido às distâncias maiores. No geral, caminhar é uma maneira prática de explorar o charme histórico da cidade e as comodidades próximas.

Andar de bicicleta em San Juan Capistrano oferece várias oportunidades, com algumas áreas de infraestrutura disponíveis, como calçadas e trajetos adequados para bicicletas. O layout compacto da cidade facilita o acesso aos principais destinos de bicicleta, embora alguns trajetos possam exigir a navegação por ruas mais movimentadas. O clima ampliado geralmente proporciona condições confortáveis para a bicicleta o ano todo. No entanto, a disponibilidade de ciclovias pode variar. Por isso, os usuários precisam planejar os trajetos com cuidado para aumentar a segurança.

O transporte público em San Juan Capistrano oferece opções úteis para se locomover pela região. O serviço de trem Metrolink conecta a cidade a outras partes do sul da Califórnia, sendo uma escolha conveniente para viagens regionais. Também há ônibus locais e shuttles em operação, facilitando o acesso a destinos importantes. O centro compacto e de fácil circulação a pé, especialmente na área histórica, complementa o transporte público. No entanto, algumas áreas podem exigir planejamento extra devido à distância ou rotas limitadas. O clima ameno geralmente favorece viagens confortáveis de transporte público durante todo o ano.