Сан-Хуан-Капистрано предлагает удобную для пешеходов среду, особенно в центре города, где многие достопримечательности расположены в шаговой доступности. Исторический район, включая Миссию и улицу Лос-Риос, компактный и легко проходимый пешком, а тротуары и пешеходные переходы обеспечивают безопасный доступ. Мягкий климат Южной Калифорнии также способствует выбору пеших прогулок в качестве способа передвижения. Однако для поездок за пределы центрального района могут понадобиться другие виды транспорта из-за больших расстояний. В целом, пешие прогулки — это удобный способ познакомиться с историческим очарованием города и его окрестностями.

В Сан-Хуан-Капистрано есть множество возможностей для велосипедного движения. Местами предусмотрены тротуары и велодорожки. Благодаря удобному планированию города легко добраться до основных пунктов назначения на велосипеде, однако для некоторых маршрутов может потребоваться движение по оживленным улицам. Мягкая погода создает комфортные условия для поездок на велосипеде в течение всего года. Однако наличие выделенных велосипедных дорожок не всегда удобно, поэтому водителям следует тщательно планировать маршрут, чтобы чувствовать себя в безопасности.

Общественный транспорт в Сан-Хуан-Капистрано включает варианты, которые могут быть полезны для передвижения по городу. Поезд Metrolink соединяет город с другими частями Южной Калифорнии, что делает его удобным выбором для поездок по региону. Также работают местные автобусные маршруты и шаттлы, обеспечивающие доступ к основным направлениям. Компактная и удобная для прогулок планировка города, особенно в районе исторического центра, хорошо сочетается с общественным транспортом. Однако для некоторых районов может потребоваться дополнительное планирование из-за удалённости или ограниченного количества маршрутов. Мягкий климат обычно способствует комфортным поездкам на общественном транспорте в течение всего года.