San Juan Capistrano erbjuder en promenadvänlig miljö, särskilt i stadens centrum där många sevärdheter ligger på gångavstånd. Det historiska området, inklusive Missionen och Los Rios Street, är kompakt och lätt att ta sig runt till fots, med trottoarer och övergångsställen som ger säker tillgång. Det milda klimatet i södra Kalifornien gör promenader till ett attraktivt transportalternativ. Däremot kan områden utanför centrum kräva andra transportmedel på grund av längre avstånd. Sammantaget är det praktiskt att utforska stadens historiska charm och närliggande bekvämligheter till fots.

Att cykla i San Juan Capistrano erbjuder en blandning av möjligheter, med viss infrastruktur som trottoarer och cykelvänliga vägar finns i vissa områden. Stadens kompakta planlösning gör det relativt enkelt att nå viktiga destinationer med cykel, även om vissa rutter kräver navigering på mer trafikerade gator. Det milda vädret ger i allmänhet bekväma cykelförhållanden året runt. Tillgången på särskilda cykelbanor kan dock variera, så passagerare bör planera vägarna noggrant för att garantera säkerheten.

Kollektivtrafiken i San Juan Capistrano erbjuder alternativ som kan vara användbara för att ta sig runt i området. Metrolink-tåget förbinder staden med andra delar av södra Kalifornien, vilket gör det till ett smidigt val för regionala resor. Lokala bussar och skyttlar trafikerar också området och ger tillgång till viktiga destinationer. Stadens kompakta och promenadvänliga utformning, särskilt kring det historiska distriktet, kompletterar kollektivtrafiken. Vissa områden kan dock kräva extra planering på grund av avstånd eller begränsade rutter. Det milda vädret bidrar generellt till bekväma resor med kollektivtrafik året runt.