San Juan Capistrano tarjoaa jalankulkijoille ystävällisen ympäristön etenkin keskustan alueella, jossa monet nähtävyydet ovat kävelyetäisyydellä. Historiallinen alue, mukaan lukien Mission ja Los Rios Street, on pienikokoinen ja helposti navigoitavissa jalan, ja jalkakäytävät ja suojatiet tukevat turvallista kulkua. Etelä-Kalifornian leuto sää lisää kävelyä kulkuvälineenä. Keskusalueen ulkopuolella olevat alueet voivat kuitenkin tarvita vaihtoehtoisia kulkuvälineitä pitkien etäisyyksien takia. Kaiken kaikkiaan kävely on käytännöllinen tapa tutustua kaupungin historialliseen viehätysvoimaan ja lähellä oleviin palveluihin.

Pyöräily San Juan Capistranossa tarjoaa monia mahdollisuuksia, ja tietyillä alueilla on tarjolla infrastruktuuria, kuten jalkakäytäviä ja pyöräilyyn sopivia reittejä. Kaupungin kompaktin pohjaratkaisun ansiosta tärkeimpiin kohteisiin pääsee suhteellisen helposti pyörällä, vaikka jotkut reitit saattavat edellyttää navigointia vilkkaampia katuja pitkin. Leuto sää tukee yleensä mukavia pyöräilyolosuhteita ympäri vuoden. Erillisten pyöräkaistojen saatavuus voi kuitenkin vaihdella, joten matkustajien tulee suunnitella reitit huolellisesti turvallisuuden varmistamiseksi.

Public transportation in San Juan Capistrano includes options that can be useful for navigating the area. The Metrolink train service connects the city to other parts of Southern California, making it a convenient choice for regional travel. Local bus services and shuttles also operate, providing access to key destinations. The town’s compact and walkable layout, especially around the historic district, complements public transit. However, some areas may require additional planning due to distance or limited routes. The mild weather generally supports comfortable travel by public transit throughout the year.