San Juan Capistrano oferece um ambiente favorável aos peões, especialmente na zona do centro, onde muitas atrações estão localizadas a uma curta distância a pé. O bairro histórico, que inclui a Missão e a Rua Los Rios, é compacto e fácil de percorrer a pé, com passeios e passadeiras que garantem um acesso seguro. O clima ameno do sul da Califórnia também favorece as deslocações a pé. No entanto, as zonas fora do centro podem exigir alternativas de transporte devido às distâncias maiores. No geral, caminhar é uma forma prática de explorar o charme histórico da vila e as comodidades próximas.

Andar de bicicleta em San Pedro Capistrano oferece uma série de oportunidades, disponibilizando algumas infraestruturas, como passeios e rotas adaptadas para bicicletas, em determinadas áreas. A disposição reduzida da cidade torna relativamente fácil chegar a destinos importantes de bicicleta, embora algumas rotas possam exigir a navegação por ruas mais movimentadas. Em geral, o tempo bom permite condições confortáveis para a utilização de bicicletas durante todo o ano. No entanto, a disponibilidade de ciclovias exclusivas pode variar, por isso, os utilizadores devem planear as rotas cuidadosamente para garantir a segurança.

O transporte público em San Juan Capistrano inclui opções que podem ser úteis para se deslocar na zona. O serviço de comboios Metrolink liga a cidade a outras partes do sul da Califórnia, tornando-o uma escolha conveniente para viagens regionais. Também existem autocarros locais e shuttles, que facilitam o acesso a destinos importantes. O centro compacto e pedonal da cidade, especialmente na zona histórica, complementa o transporte público. No entanto, algumas áreas podem exigir um planeamento adicional devido à distância ou a percursos limitados. O clima ameno geralmente permite viajar confortavelmente em transporte público durante todo o ano.