East Setauket features a mix of opportunities for walking, with some areas being more accessible than others. The region includes parks and trails, such as Avalon Park and Preserve and Frank Melville Memorial Park, which provide pleasant walking environments. However, the suburban layout and distances between key destinations may make walking less practical for errands or commuting. Sidewalks and pedestrian infrastructure are present in some areas, but they may not be consistent throughout the town. Seasonal weather, including cold winters and humid summers, can also influence the comfort of walking as a primary mode of transportation.

Pyöräily East Setauketissa on käytännöllinen vaihtoehto tietyillä alueilla, kiitos alueen esikaupunkimaisen ja luonnonläheisen ympäristön. Alueella on joitakin pyöräilyyn sopivia reittejä, kuten polkuja ja rauhallisia asuinkatuja, jotka voivat tarjota miellyttävän pyöräilykokemuksen. Omistettujen pyöräteiden tai laajemman pyöräilyinfrastruktuurin saatavuus voi kuitenkin vaihdella, ja jotkin pääväylät voivat olla haastavia liikenteen vuoksi. Myös tärkeimpien kohteiden välimatkat voivat vaikuttaa siihen, kuinka kätevää pyöräily on ensisijaisena liikkumismuotona.

Joukkoliikennevaihtoehdot East Setauketissa tarjoaa pääasiassa Suffolk County Transit -bussit, jotka yhdistävät alueen lähikohteisiin. S60/S69-bussilinjat mahdollistavat pääsyn naapurikaupunkeihin, mukaan lukien Stony Brook. Vaikka julkista liikennettä on saatavilla, alueen esikaupunkimainen rakenne voi tehdä joidenkin kohteiden saavuttamisesta suoraan vähemmän kätevää. Kävelymatkat bussipysäkeille ja vuorojen tiheys voivat vaikuttaa sen käytännöllisyyteen. Lisäksi Long Island Rail Road (LIRR) tarjoaa junayhteyden läheiseltä Stony Brookin asemalta, mikä voi olla hyödyllistä pidemmille matkoille.

Lautat ovat yksi liikkumisvaihtoehto East Setauketin lähellä, erityisesti läheisen Port Jeffersonin lauttayhteyden kautta, joka yhdistää Bridgeportiin, Connecticutiin. Bridgeport and Port Jefferson Steamboat Companyn operoima lautta kulkee tunnin välein ja kuljettaa jalankulkijoita, autoja ja polkupyöriä. Matka kestää tyypillisesti noin tunnin, mikä tekee siitä käytännöllisen vaihtoehdon mantereen ylittävään matkustamiseen. Lautta toimii kuitenkin ensisijaisesti alueellisena yhteytenä eikä paikallisena joukkoliikennevaihtoehtona East Setauketin sisällä. Pääsy lauttaterminaaliin ja sääolosuhteet voivat vaikuttaa sen sopivuuteen, erityisesti niille, jotka ovat riippuvaisia paikallisesta infrastruktuurista satamaan päästäkseen.