Port Jeffersonin keskusta-alue on kompakti ja helppokulkuinen jalankulkijoille sopiva ympäristö. Kylän ulkoasu, sen historiallinen viehätys ja lähellä rantaa tekevät kävelystä miellyttävän tavan tutustua kauppoihin, ravintoloihin ja kulttuurikohteisiin. Jalankulku- ja suojatiet ovat hyvin hoidettuja ja tukevat jalankulkijoiden turvallista liikkumista. Vaikka alue on yleensä kävelykelpoinen, jotkin mäkiset maastot voivat vaatia tietyillä alueilla kohtuullista vaivaa. Yhdysvaltojen koillisosille tyypilliset sääolosuhteet voivat vaihdella, joten mukavia kävelykenkiä ja vuodenaikojen mukaisia asuja suositellaan parhaan mahdollisen käyttökokemuksen varmistamiseksi.

For those comfortable navigating mixed-use paths and local trails, biking is a practical way to get around Port Jefferson. The area features routes like the Setauket Greenway Trail, which offers a scenic and bike-friendly environment. Additionally, the North Shore “rails to trails” path connects Port Jefferson Station to Wading River, providing a longer biking option. While some bike infrastructure exists, riders should be mindful of traffic and road conditions in certain areas. The town’s compact layout and accessible trails make biking a reasonable choice for short to moderate distances.

Port Jeffersonin joukkoliikennevaihtoehtoja ovat Long Island Rail Road (LIRR) ja Suffolk County Transit ‐bussit. LIRR-lentoaseman Port Jefferson Branch yhdistää alueen muihin Long Islandin osiin, joten se on käytännöllinen vaihtoehto pidemmille matkoille. Suffolk County Transit liikennöi bussireittejä paikallisiin kohteisiin, mutta aikataulut ja reitit saattavat edellyttää suunnittelua. Kaupungin infrastruktuuri tukee näitä palveluita, mutta mäkinen pinnanmuodostus ja hajautus voivat vaikeuttaa kävelyä joukkoliikennepysäkeille joillakin alueilla. Julkinen liikenne voi olla hyödyllinen vaihtoehto määränpäästä ja joukkoliikennekeskusten läheisyydestä riippuen.

Lautat tarjoavat kätevän matkustusvaihtoehdon Port Jeffersonista ja tarjoavat ympärivuotista palvelua Port Jeffersonin, New Yorkin ja Bridgeportin, Connecticutin välillä. Lautat sopivat jalankulkijoille, autoille ja polkupyörille, joten ne sopivat erilaisiin matkustustarpeisiin. Purjehdukset kulkevat yleensä useita kertoja päivässä, ja matka kestää noin 1 tunti ja 15 minuuttia. Lauttaterminaali sijaitsee keskeisellä paikalla, ja sieltä pääsee helposti läheisille nähtävyyksille. Vaikka sääolosuhteet voivat joskus vaikuttaa aikatauluihin, infrastruktuuri tukee sujuvaa kyytiin nousemista kaikentyyppisille matkustajille. Lautat ovat erityisen hyödyllisiä niille, jotka haluavat välttää pitkiä matkoja tai matkustaa veden yli.