East Setauket features a mix of opportunities for walking, with some areas being more accessible than others. The region includes parks and trails, such as Avalon Park and Preserve and Frank Melville Memorial Park, which provide pleasant walking environments. However, the suburban layout and distances between key destinations may make walking less practical for errands or commuting. Sidewalks and pedestrian infrastructure are present in some areas, but they may not be consistent throughout the town. Seasonal weather, including cold winters and humid summers, can also influence the comfort of walking as a primary mode of transportation.

Fietsen in East Setauket is in bepaalde gebieden een praktische optie, dankzij de combinatie van een suburbaan karakter en natuurlijke landschappen. De regio beschikt over enkele fietsvriendelijke routes, zoals paden en rustige woonstraten, die een prettige rijervaring kunnen bieden. De aanwezigheid van speciale fietspaden of uitgebreide fietsinfrastructuur kan echter verschillen, en sommige hoofdwegen kunnen door het verkeer uitdagingen opleveren. Ook de afstanden tussen belangrijke bestemmingen in het gebied kunnen van invloed zijn op het gemak waarmee fietsen als voornaamste vervoersmiddel wordt gebruikt.

Openbaar vervoer in East Setauket wordt voornamelijk verzorgd door Suffolk County Transit-bussen, die het gebied verbinden met nabijgelegen locaties. De buslijnen S60/S69 bieden toegang tot omliggende plaatsen, waaronder Stony Brook. Hoewel er openbaar vervoer beschikbaar is, kan de suburbane indeling van de regio het minder gemakkelijk maken om sommige bestemmingen direct te bereiken. De loopafstanden naar bushaltes en de frequentie van de dienst kunnen de praktische bruikbaarheid beïnvloeden. Daarnaast biedt de Long Island Rail Road (LIRR) treinverbindingen vanaf het nabijgelegen Stony Brook Station, wat handig kan zijn voor langere reizen.

Veerboten zijn een vervoersoptie in de buurt van East Setauket, met name via de nabijgelegen veerboot Port Jefferson, die verbinding biedt met Bridgeport, Connecticut. Deze veerboot van de Bridgeport and Port Jefferson Steamboat Company vaart elk uur en is geschikt voor voetgangers, auto's en fietsen. De rit duurt meestal ongeveer een uur, waardoor het een praktische keuze is voor reizen met een ander geluid. De veerboot dient echter voornamelijk als een regionale verbindingsoptie in plaats van een lokale ov-optie binnen East Setauket. De toegankelijkheid van de veerbootterminal en de weersomstandigheden kunnen van invloed zijn op de geschiktheid, vooral voor mensen die afhankelijk zijn van lokale infrastructuur om de haven te bereiken.