Spacer po Stony Brook może być przyjemnym sposobem na poznanie niektórych okolic, zwłaszcza w pobliżu uniwersytetu oraz sąsiedniej dzielnicy Three Village, gdzie znajdują się strefy przyjazne pieszym i malownicze otoczenie. Jednak ze względu na podmiejski charakter regionu, niektóre miejsca mogą być oddalone od siebie, co sprawia, że dłuższe spacery są mniej praktyczne. W niektórych rejonach chodniki i poprawiona infrastruktura uliczna ułatwiają poruszanie się pieszo, ale ogólnie infrastruktura nie zawsze stawia pieszych na pierwszym miejscu. Zmienna pogoda, w tym mroźne zimy i wilgotne lata, również może wpływać na komfort spacerowania.

For those looking to bike in Stony Brook, it can be a practical way to get around, especially for shorter distances. The area features some bike-friendly infrastructure, including paths and bike racks, particularly around Stony Brook University. However, the ease of biking may vary depending on specific routes, as some areas may lack dedicated bike lanes. The region’s terrain is generally manageable for cyclists, but distances between destinations could be a consideration for some. Additionally, Stony Brook University offers a bike share program, which can be a convenient option for getting around campus and nearby areas.

Opcje transportu publicznego w Stony Brook obejmują kolej Long Island Railroad (LIRR) oraz autobusy Suffolk County Transit. LIRR zapewnia połączenia z okolicznymi miejscowościami i Nowym Jorkiem, natomiast autobusy Suffolk County Transit obsługują lokalne trasy, w tym dojazd do Uniwersytetu Stony Brook. Infrastruktura wspiera te usługi poprzez wyznaczone przystanki i rozkłady jazdy, jednak rozległy charakter okolicy może sprawiać, że niektóre miejsca są mniej wygodne do osiągnięcia autobusem. Warunki pogodowe mogą czasami wpływać na rozkłady jazdy, dlatego zaleca się wcześniejsze planowanie podróży dla sprawnego przejazdu.

Promy stanowią praktyczną opcję transportu do Stony Brook, szczególnie dla osób podróżujących z Connecticut. Cross Sound Ferry kursuje przez cały rok między New London w Connecticut a Orient Point w stanie Nowy Jork, oferując rejsy dla samochodów, rowerów i pieszych. Podróż zazwyczaj trwa około 80 minut. Z Orient Point do Stony Brook jest około 50 mil jazdy na zachód. Choć promy zapewniają malowniczy i sprawny sposób przeprawy przez Long Island Sound, ich wykorzystanie do podróży lokalnych w obrębie Stony Brook jest ograniczone ze względu na brak bezpośrednich połączeń promowych do samego miasta.