Centrum Port Jefferson jest zwarte i łatwe do poruszania się pieszo, oferując przyjazne środowisko dla pieszych. Układ miasteczka, z jego historycznym urokiem i bliskością nabrzeża, sprawia, że spacerowanie to przyjemny sposób na odkrywanie sklepów, restauracji i atrakcji kulturalnych. Chodniki i przejścia dla pieszych są dobrze utrzymane, co sprzyja bezpiecznemu przemieszczaniu się pieszo. Choć okolica jest na ogół dogodna do spacerów, miejscami występują pagórkowate tereny, które mogą wymagać nieco większego wysiłku. Warunki pogodowe, typowe dla północno-wschodniej części USA, mogą się zmieniać, dlatego dla najlepszego komfortu zaleca się wygodne buty do chodzenia i ubranie dostosowane do pory roku.

For those comfortable navigating mixed-use paths and local trails, biking is a practical way to get around Port Jefferson. The area features routes like the Setauket Greenway Trail, which offers a scenic and bike-friendly environment. Additionally, the North Shore “rails to trails” path connects Port Jefferson Station to Wading River, providing a longer biking option. While some bike infrastructure exists, riders should be mindful of traffic and road conditions in certain areas. The town’s compact layout and accessible trails make biking a reasonable choice for short to moderate distances.

Opcje transportu publicznego w Port Jefferson obejmują Long Island Rail Road (LIRR) oraz autobusy Suffolk County Transit. Linia Port Jefferson Branch LIRR łączy tę okolicę z innymi częściami Long Island, co czyni ją praktycznym wyborem na dłuższe trasy. Suffolk County Transit obsługuje linie autobusowe, które umożliwiają dojazd do lokalnych miejsc, choć rozkłady jazdy i trasy mogą wymagać wcześniejszego zaplanowania. Infrastruktura miasta wspiera te usługi, jednak pagórkowate ukształtowanie terenu i rozproszona zabudowa mogą sprawiać, że dojście do przystanków transportu publicznego jest w niektórych miejscach mniej wygodne. Transport publiczny może być przydatną opcją w zależności od celu podróży i bliskości węzłów komunikacyjnych.

Promy zapewniają wygodną opcję podróży z Port Jefferson i oferują całoroczne połączenia między Port Jefferson w stanie Nowy Jork a Bridgeport w stanie Connecticut. Promy są przystosowane do przewozu pieszych, samochodów i rowerów, dzięki czemu sprawdzają się w różnych sytuacjach. Przeprawy zwykle kursują kilka razy dziennie, a przeprawa trwa około godziny i 15 minut. Terminal promowy jest centralnie położony, dzięki czemu można z łatwością dostać się do pobliskich atrakcji. Chociaż warunki pogodowe mogą czasami wpłynąć na harmonogram, infrastruktura umożliwia bezproblemowe wchodzenie na pokład wszystkim pasażerom. Promy są szczególnie przydatne dla osób, które chcą uniknąć długich przejazdów lub połączyć się z miejscami za oceanem.