San Juan Capistrano biedt een voetgangersvriendelijke omgeving, vooral in het centrum, waar veel bezienswaardigheden op loopafstand liggen. De historische wijk, met inbegrip van de Mission en Los Rios Street, is compact en makkelijk te voet bevaarbaar, met trottoirs en zebrapaden voor veilige toegang. Het milde weer in Zuid-Californië vormt een aanvulling op wandelen als vervoersoptie. Voor gebieden buiten het centrale district kan echter alternatief vervoer nodig zijn vanwege de grotere afstanden. Over het algemeen is wandelen een praktische manier om de historische charme van de stad en de nabijgelegen voorzieningen te verkennen.

Fietsen in San Juan Capistrano biedt een mix van mogelijkheden, met in bepaalde gebieden infrastructuur, zoals trottoirs en fietsvriendelijke routes. Door de compacte lay-out van de stad zijn de belangrijkste bestemmingen relatief eenvoudig per fiets te bereiken, hoewel je voor sommige routes misschien door drukkere straten moet. Door het zachte weer zijn het over het algemeen het hele jaar door comfortabele fietsomstandigheden. De beschikbaarheid van speciale fietspaden kan echter variëren, dus passagiers moeten routes zorgvuldig plannen om de veiligheid te garanderen.

Public transportation in San Juan Capistrano includes options that can be useful for navigating the area. The Metrolink train service connects the city to other parts of Southern California, making it a convenient choice for regional travel. Local bus services and shuttles also operate, providing access to key destinations. The town’s compact and walkable layout, especially around the historic district, complements public transit. However, some areas may require additional planning due to distance or limited routes. The mild weather generally supports comfortable travel by public transit throughout the year.