San Diego tilbyr et fotgjengervennlig miljø med fokus på infrastruktur for aktiv transport. Byen har investert i belysning tilpasset fotgjengere, godt synlige fotgjengerfelt og bredere fortau, noe som gjør det praktisk å gå til fots i mange områder. Det milde klimaet gjør det enda mer attraktivt å gå, og gir behagelige turer året rundt. Byens utstrakte utforming betyr imidlertid at enkelte reisemål kan være for langt unna til å nå til fots, og det kan derfor være nødvendig å bruke andre transportmidler for lengre reiser. Alt i alt er det å gå et praktisk valg for å utforske lokale nabolag og få tilgang til nærliggende fasiliteter.

San Diego byr på en behagelig sykkelopplevelse med sitt omfattende nettverk av sykkelfelt og sykkelstier. Byen har lagt til mange kilometer med sykkelfelt og adskilte sykkelveier, noe som gjør det enklere å komme seg til ulike destinasjoner med sykkel. Det milde været året rundt er ideelt for sykling, og byens satsing på å forbedre sykkelinfrastrukturen støtter denne transportformen. Selv om noen områder kan ha lengre avstander, gjør den samlede infrastrukturen sykling til et praktisk alternativ for å komme seg rundt.

Byen har en rekke alternativer for offentlig transport, noe som gjør det relativt enkelt å komme seg rundt i byen uten bil. Metropolitan Transit System (MTS) tilbyr omfattende bussruter og trolleylinjer, inkludert Blue, Green, Orange og Copper Lines, som forbinder viktige områder og populære destinasjoner som San Diego Zoo og Petco Park. The Rapid Bus Service tilbyr raskere reiser på utvalgte ruter. Byens infrastruktur støtter disse tjenestene godt, og det milde været gjør det generelt behagelig å vente på transport. Offentlig transport er et praktisk valg for å komme deg rundt i San Diego.

Ferger i San Diego tilbyr en naturskjønn og effektiv måte å reise mellom sentrum og Coronado på. Fergeforbindelsen går daglig, med avgang fra Broadway Pier hver time og fra San Diego Convention Center på en halv time. Turen tar omtrent 15 minutter, noe som gir en rask og problemfri reise over bukten. Ferger er fotgjenger- og sykkelvennlige, slik at passasjerene kan ta med sykler uten ekstra kostnader. Selv om det ikke er plass til biler, er fergen et flott alternativ for de som vil utforske området til fots eller på sykkel. Det rolige vannet i San Diego Bay gjør turen til en hyggelig tur, og fergen er lett tilgjengelig til viktige steder som et transportalternativ.