Å gå til fots i Eagan kan være et praktisk alternativ i enkelte områder, takket være et nettverk av fortau og fotgjengervennlig infrastruktur. Byens utforming og forstads­preg gjør imidlertid at mange reisemål kan være spredt, noe som gjør det mindre praktisk å gå lengre strekninger. Sesongbasert vær, inkludert kalde vintre og tidvis snø, kan også påvirke forholdene for gående. Selv om noen områder er tilgjengelige til fots, passer det ofte bedre for korte avstander eller rekreasjon enn som hovedtransportmiddel.

Å sykle i Eagan er et praktisk alternativ for å komme seg rundt, takket være byens nettverk av sykkelvennlige stier og ruter. Byen tilbyr asfalterte stier og forbindelser til regionale løyper, noe som gjør det enklere å komme seg mellom nabolag og nærliggende reisemål. Selv om terrenget stort sett er lett å håndtere, kan noen ruter innebære moderate avstander, så det er lurt å planlegge på forhånd. Byens infrastruktur legger til rette for sykling, men værforhold, spesielt i de kaldere månedene, kan påvirke komfort og sikkerhet.

Offentlig transport i Eagan støttes av et nettverk av bussruter som drives av Minnesota Valley Transit Authority, som forbinder viktige områder i byen og nærliggende lokalsamfunn. Eagan Transit Station fungerer som et sentralt knutepunkt, og tilbyr parkering og turer. Selv om busser gir tilgang til mange destinasjoner, kan den spredte naturen i området gjøre enkelte steder mindre tilgjengelige uten ekstra reiser. Værforhold, spesielt om vinteren, kan påvirke rutetider og komfort, så planlegging er viktig. Offentlig transport kan være et praktisk alternativ, avhengig av destinasjon og tidspunkt.