Alcalá de Henares es una ciudad cómoda para peatones, con un diseño compacto que facilita recorrer a pie sus calles históricas y lugares de interés. Las aceras y zonas peatonales bien cuidadas, especialmente en el centro histórico, ofrecen una experiencia agradable al caminar. Muchos de los principales puntos de interés, como la universidad y los espacios culturales, se encuentran a poca distancia entre sí. El clima, generalmente templado, también favorece caminar como opción práctica durante gran parte del año, aunque en verano conviene tomar precauciones como mantenerse hidratado. En conjunto, caminar es una forma práctica de descubrir las encantadoras calles de la ciudad.

Ir en bicicleta por Alcalá de Henares es una opción práctica, ya que la ciudad cuenta con una combinación de zonas urbanas y residenciales con distancias manejables para desplazarse en bici. La infraestructura incluye carriles y caminos para bicicletas que facilitan el acceso a ciertas partes de la ciudad para los ciclistas. El terreno relativamente llano en muchas zonas también favorece unas condiciones cómodas para ir en bici. Sin embargo, algunas rutas pueden requerir mayor precaución debido al tráfico o a la infraestructura limitada específica para ciclistas.

El sistema de transporte público en Alcalá de Henares ofrece una forma cómoda de desplazarse, con una red de líneas de autobús urbano que conecta las zonas clave de la ciudad. La localidad también está bien comunicada con Madrid mediante trenes regionales, lo que la hace accesible para quienes viajan por trabajo o para visitantes. La infraestructura facilita la movilidad, y tanto los autobuses como los trenes son fiables para llegar a los destinos más populares. El diseño compacto de la ciudad favorece el transporte público, reduciendo la necesidad de trayectos largos.