在巴拿馬市的某些地區，步行是一個實用的選擇，特別是在擁有完善人行道設施的社區。不過，這座城市的設計以車輛為主，有些區域可能缺乏足夠的人行道或對行人友善的步道。熱帶氣候帶來高濕度和頻繁降雨，也會讓步行變得不那麼舒適，尤其是在雨季期間。主要目的地之間的距離不一，因此步行未必總是最高效的方式。建議在景點和設施集中、區域較小的地段以步行方式探索。

在巴拿馬市騎自行車可能會面臨挑戰，因為許多地區缺乏專用自行車道和相關基礎設施。城市的布局與交通狀況，尤其是在繁忙或壅塞的區域，可能讓自行車騎乘變得不易且不夠安全。此外，潮濕的氣候也會讓長距離騎乘變得較不舒適。雖然部分地區可以騎自行車通行，但由於基礎設施尚未普及，加上城市地形因素，騎自行車並不是最方便的代步選擇。

巴拿馬市的公共交通選擇多元，包括公車和地鐵系統。地鐵是穿梭市區，特別是前往市中心的高效且經濟實惠方式。公車稱為 Metro Bus，路線覆蓋廣泛，但需使用預付的 Metro Card 進站。當地交通基礎設施完善，方便市內移動，不過熱帶氣候可能影響通勤時的舒適度。整體而言，公共交通是市區出行的實用選擇，特別適合短程移動或想避開市區車流的旅客。

巴拿馬市的渡輪為前往附近島嶼（如塔博加島）提供了便利的交通方式，每天都有適合步行旅客的航班。前往塔博加島的航程約需 30 分鐘，對旅客來說是一個快速且容易抵達的選擇。渡輪通常從阿馬多堤道出發，班次頻繁，方便安排一日遊。雖然渡輪無法載運汽車或自行車，但設施完善，登船與旅程都十分順暢。天氣狀況偶爾會影響班次，但整體而言，渡輪是探索巴拿馬市周邊景點既可靠又風景優美的方式。