San Marcos, California, are un nivel moderat de accesibilitate pietonală, cu unele zone mai prietenoase pentru pietoni decât altele. Deși orașul oferă trasee și alei pentru mers pe jos, o mare parte din infrastructură este concepută pentru vehicule, ceea ce face ca mersul pe jos să fie mai puțin convenabil pentru accesarea destinațiilor zilnice. Distanțele dintre punctele cheie, cum ar fi centrele comerciale și zonele rezidențiale, pot fi considerabile, ceea ce poate descuraja mersul pe jos ca principal mod de transport. Totuși, clima blândă din sudul Californiei este, în general, favorabilă activităților în aer liber, inclusiv mersului pe jos.

Deplasarea cu bicicleta în San Marcos oferă o varietate de oportunități datorită infrastructurii care include benzi și trasee pentru biciclete în anumite zone, facilitând accesul către unele destinații pe două roți. Configurația orașului și rutele disponibile pot susține mersul cu bicicleta pentru deplasări scurte sau în scop recreativ. Totuși, relieful deluros din unele părți ale zonei poate reprezenta o provocare pentru unii bicicliști. Vremea blândă oferă, în general, condiții favorabile pentru ciclism, însă distanțele dintre punctele cheie pot face ca mersul cu bicicleta să fie mai puțin practic pentru deplasări mai lungi.

Opțiunile de transport public în San Marcos includ servicii de autobuz și tren ușor care conectează zonele cheie din oraș și regiunile învecinate. Sistemul de autobuze BREEZE și trenul ușor SPRINTER sunt servicii importante, oferind acces către destinații precum colegii, centre comerciale și zone rezidențiale. Trenul ușor SPRINTER circulă între Oceanside și Escondido, cu opriri în San Marcos, fiind o alegere convenabilă pentru navete mai lungi. Deși există transport public, configurația regiunii și distanțele dintre unele destinații pot necesita planificare suplimentară pentru o călătorie fără întreruperi.