Alcalá de Henares és una ciutat amigable per als vianants amb un traçat compacte que fa que caminar sigui una manera accessible d’explorar els seus carrers i atractius històrics. Les voreres i zones per a vianants ben cuidades de la ciutat, especialment al centre històric, ofereixen una experiència agradable per passejar. Molts dels principals punts d’interès, com la universitat i els espais culturals, es troben a poca distància entre si. El clima generalment suau també afavoreix caminar com una opció pràctica durant bona part de l’any, tot i que la calor de l’estiu pot requerir precaucions com mantenir-se hidratat. En general, caminar és una manera còmoda de recórrer els encantadors carrers de la ciutat.

Anar en bicicleta per Alcalá de Henares és una opció pràctica, ja que la ciutat compta amb una combinació de zones urbanes i suburbials amb distàncies assequibles per desplaçar-se en bici. La infraestructura inclou carrils i vies per a bicicletes que faciliten l'accés a determinades parts de la ciutat per als ciclistes. El terreny relativament pla en moltes zones també afavoreix unes condicions còmodes per anar en bicicleta. Tot i això, algunes rutes poden requerir més precaució a causa del trànsit o de la infraestructura específica per a ciclistes limitada.

El sistema de transport públic d'Alcalá de Henares ofereix una manera còmoda de desplaçar-se, amb una xarxa de línies d'autobús urbà que connecten les zones clau de la ciutat. La localitat també està ben connectada amb Madrid mitjançant trens regionals, cosa que la fa accessible tant per a persones que es desplacen diàriament com per a visitants. La infraestructura facilita la navegació, i tant els autobusos com els trens són fiables per arribar a destinacions populars. El disseny compacte de la ciutat complementa el transport públic, reduint la necessitat de trajectes llargs.