Pješačenje je izvrstan način za kretanje po San Miguel de Allendeu, osobito u njegovom kompaktom i pješački pristupačnom gradskom središtu. Povijesne ulice popločene kamenjem i uski nogostupi potiču istraživanje pješice, omogućujući jednostavan pristup brojnim znamenitostima, trgovinama i restoranima. Ipak, strmi usponi i neravne površine u nekim dijelovima mogu predstavljati izazov osobama s poteškoćama u kretanju. Blaga klima općenito čini pješačenje ugodnim, iako je udobna obuća nužna za snalaženje po terenu. Za većinu posjetitelja, pješačenje je praktičan i potpun način doživljavanja šarma ovog živopisnog grada.

Vožnja biciklom u San Miguel de Allendeu predstavlja određene izazove zbog strmih uzbrdica i popločanih ulica. Iako su neki dijelovi grada dostupni biciklom, neravan teren i stanje cesta zahtijevaju oprez i možda nisu idealni za sve bicikliste. Kompaktna veličina grada znači da su udaljenosti uglavnom kratke, ali nedostatak posebnih biciklističkih staza i topografija mogu odvratiti rekreativne bicikliste.

Javni prijevoz u San Miguel de Allendeu je ograničen; autobusi uglavnom povezuju obližnja mjesta i gradove, a ne služe kao sveobuhvatna opcija za kretanje unutar samog grada. Uske ulice popločene kamenjem i brdovit teren otežavaju vožnju autobusom na kratkim relacijama. Lokalni taksiji češće se koriste za vožnju po gradu, a hodanje je često omiljeno zbog kompaktne strukture povijesnog centra. Javni prijevoz prikladniji je za dolazak do odredišta izvan grada nego za svakodnevno kretanje unutar San Miguel de Allendea.