San Diego tarjoaa jalankulkijaystävällisen ympäristön, jossa painotetaan aktiivisen liikkumisen infrastruktuuria. Kaupunki on panostanut jalankulkijoille suunnattuun valaistukseen, hyvin näkyviin suojateihin ja levennettyihin jalkakäytäviin, mikä tekee kävelystä kätevän vaihtoehdon monilla alueilla. Leuto ilmasto lisää kävelyn houkuttelevuutta, mahdollistaen miellyttävät kävelyretket ympäri vuoden. Kuitenkin kaupungin laaja-alainen rakenne tarkoittaa, että jotkin kohteet voivat olla liian kaukana pelkkää kävelyä varten, jolloin pidemmille matkoille tarvitaan muita liikkumismuotoja. Kaiken kaikkiaan kävely on käytännöllinen valinta paikallisten kaupunginosien tutkimiseen ja lähellä olevien palveluiden saavuttamiseen.

San Diego tarjoaa miellyttävän pyöräilykokemuksen laajan pyöräteiden ja -kaistojen verkostonsa ansiosta. Kaupunki on lisännyt lukuisia kilometrejä pyöräkaistoja ja erillisiä pyöräteitä, mikä helpottaa eri kohteisiin pääsyä pyörällä. Lämmin sää ympäri vuoden on ihanteellinen pyöräilyyn, ja kaupungin panostukset pyöräilyinfrastruktuurin parantamiseen tukevat tätä kulkumuotoa. Vaikka joillakin alueilla etäisyydet voivat olla pidempiä, kokonaisuudessaan infrastruktuuri tukee pyöräilyä käytännöllisenä liikkumisvaihtoehtona.

Kaupungissa on useita joukkoliikennevaihtoehtoja, joten kaupungissa on suhteellisen helppo liikkua ilman autoa. Metropolitan Transit System (MTS) tarjoaa laajat bussi- ja raitiovaunulinjat, kuten Blue-, Green-, Orange- ja Copper Lines, jotka yhdistävät tärkeimmät alueet ja suosittuja kohteita, kuten San Diegon eläintarhan ja Petco Parkin. Rapid Bus Service tarjoaa nopeampia matkoja tietyillä reiteillä. Kaupungin infrastruktuuri tukee näitä palveluita hyvin, ja leuto sää tekee kuljetusten odottamisesta yleensä mukavaa. Julkinen liikenne on käytännöllinen vaihtoehto San Diegossa liikkumiseen.

Lautat San Diegossa tarjoavat luonnonkauniin ja tehokkaan tavan matkustaa keskustan ja Coronadon välillä. Lautta kulkee päivittäin, ja se lähtee Broadwayn laiturilta tunnin välein ja San Diegon kongressikeskuksesta puolen tunnin välein. Kyyti kestää noin 15 minuuttia, joten matka lahden yli on nopea ja sujuva. Lautat ovat jalankulkijoille ja pyöräilijöille sopivia, joten matkustajat voivat tuoda polkupyöriä ilman lisämaksua. Vaikka autoihin ei mahdu autoja, lautta on loistava vaihtoehto niille, jotka matkustavat jalan tai pyörällä. San Diego Bayn rauhalliset vedet tarjoavat miellyttävän kyydin, ja lautan saavutettavuus keskeisiin paikkoihin lisää sen houkuttelevuutta kuljetusvaihtoehtona.